MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni M1 chromosome

Total Repeats: 2909

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017280	AAAT	2	8	1339	1346	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017280	A	7	7	1358	1364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017280	ATT	2	6	1399	1404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017280	GAA	2	6	1412	1417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017280	CAA	2	6	1429	1434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017280	TTA	3	9	1437	1445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017280	TAAAAT	2	12	1455	1466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017280	GAA	2	6	4899	4904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017280	T	7	7	6521	6527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017280	TAT	2	6	6532	6537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017280	AAT	2	6	6554	6559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017280	A	6	6	6583	6588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017280	ATT	2	6	6593	6598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017280	TAAAA	2	10	6616	6625	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017280	TTA	2	6	6644	6649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017280	T	6	6	6663	6668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017280	ATT	2	6	6688	6693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017280	T	6	6	8030	8035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017280	ATTT	3	12	8037	8048	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017280	A	7	7	8074	8080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017280	TTA	2	6	8125	8130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017280	AAG	2	6	14676	14681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017280	A	6	6	14954	14959	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017280	T	6	6	15658	15663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017280	GTATT	2	10	15676	15685	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017280	A	7	7	15688	15694	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017280	TAA	2	6	15708	15713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017280	AAAT	2	8	15742	15749	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017280	A	6	6	15784	15789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017280	TTA	2	6	15790	15795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017280	AAAAT	2	10	18044	18053	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017280	TTTA	2	8	18070	18077	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017280	AATTTA	2	12	19355	19366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017280	CCTT	2	8	21641	21648	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017280	ATT	2	6	21657	21662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017280	A	7	7	21696	21702	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017280	ACCAA	2	10	21726	21735	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
38	NC_017280	TTTTCT	2	12	21744	21755	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017280	T	6	6	21758	21763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017280	TAA	2	6	21791	21796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017280	AAAAT	2	10	21867	21876	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017280	GTTAA	2	10	21894	21903	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017280	A	6	6	21913	21918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017280	T	6	6	25558	25563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017280	ATT	2	6	25593	25598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017280	T	7	7	25597	25603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017280	A	6	6	25619	25624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017280	TGAT	2	8	25626	25633	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017280	CAT	2	6	25649	25654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017280	T	6	6	26518	26523	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017280	TTTTAT	2	12	26538	26549	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017280	TAA	2	6	26560	26565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017280	T	6	6	26596	26601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017280	AAGG	2	8	27970	27977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017280	T	6	6	32526	32531	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017280	T	6	6	32542	32547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017280	T	6	6	32560	32565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017280	A	7	7	32614	32620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017280	TTA	2	6	32627	32632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017280	TATT	2	8	35841	35848	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017280	TTA	2	6	35851	35856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017280	TA	3	6	35861	35866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017280	T	6	6	36959	36964	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017280	TAA	2	6	37018	37023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017280	TATAT	2	10	37027	37036	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017280	T	6	6	37043	37048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017280	CCA	2	6	37082	37087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_017280	TA	3	6	37094	37099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017280	TTTA	2	8	37133	37140	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017280	T	6	6	37179	37184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017280	A	6	6	37186	37191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017280	TAG	2	6	37230	37235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017280	T	6	6	37282	37287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017280	T	6	6	37298	37303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017280	CTTTT	2	10	37314	37323	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017280	T	6	6	37332	37337	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017280	TTA	2	6	37374	37379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017280	TAA	2	6	37463	37468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017280	CTTTT	2	10	37485	37494	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017280	GAA	2	6	37517	37522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017280	CTAT	2	8	37533	37540	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017280	GGC	2	6	37582	37587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017280	TA	3	6	37777	37782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017280	GGTAA	2	10	37796	37805	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017280	GAT	2	6	37844	37849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017280	GCA	2	6	37893	37898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017280	GCA	2	6	37933	37938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017280	CGC	2	6	37940	37945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_017280	GGA	2	6	37948	37953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017280	GAA	2	6	37989	37994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017280	CAG	2	6	38037	38042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017280	TGG	2	6	38196	38201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017280	CTG	2	6	38254	38259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017280	GTT	2	6	38347	38352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017280	GAA	2	6	38491	38496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017280	TGC	2	6	38571	38576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017280	GTC	2	6	38583	38588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017280	TCGTG	2	10	38592	38601	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017280	AGG	3	9	38691	38699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017280	GAC	2	6	38708	38713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017280	TCA	2	6	38720	38725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017280	AC	3	6	38746	38751	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_017280	CCT	2	6	39050	39055	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_017280	TAA	2	6	39071	39076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017280	AT	3	6	39097	39102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017280	TGA	2	6	39137	39142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017280	AGG	2	6	39200	39205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017280	CCA	2	6	39230	39235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_017280	TTA	2	6	39237	39242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017280	A	6	6	39322	39327	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017280	A	6	6	39337	39342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017280	TA	3	6	39363	39368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017280	ATTT	2	8	39406	39413	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017280	TATTTA	2	12	39471	39482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017280	AT	4	8	39499	39506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017280	CAAG	2	8	39562	39569	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_017280	TAA	2	6	39573	39578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017280	TCTTT	2	10	39620	39629	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017280	TTA	2	6	39632	39637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017280	CTA	2	6	39638	39643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017280	AAG	2	6	39729	39734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017280	AAT	2	6	39780	39785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017280	A	6	6	39793	39798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017280	CTA	2	6	39805	39810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017280	TGG	2	6	39819	39824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017280	AAG	2	6	39888	39893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017280	TA	3	6	39950	39955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017280	GCG	2	6	40026	40031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017280	TAGC	2	8	40169	40176	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017280	TGC	2	6	40482	40487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017280	GGA	2	6	40545	40550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017280	TC	3	6	40631	40636	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017280	AT	3	6	40641	40646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017280	CAG	2	6	40755	40760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017280	GGC	2	6	40764	40769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017280	CGT	2	6	40783	40788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017280	AAC	2	6	40798	40803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017280	CTTA	2	8	40831	40838	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017280	AGG	2	6	40872	40877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017280	AGC	2	6	40888	40893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017280	AAAG	2	8	40902	40909	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017280	AGTA	2	8	40962	40969	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017280	CA	3	6	40987	40992	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_017280	ATT	2	6	40999	41004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017280	AGT	2	6	41122	41127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017280	TG	3	6	41134	41139	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017280	TAAT	2	8	41232	41239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017280	AGG	2	6	41437	41442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017280	GGAT	2	8	41502	41509	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017280	AGA	2	6	41510	41515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017280	CCGTA	2	10	41567	41576	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
152	NC_017280	GGTG	2	8	41587	41594	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017280	GAA	2	6	41618	41623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017280	CT	3	6	41624	41629	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
155	NC_017280	GAA	2	6	41708	41713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_017280	CGG	2	6	41867	41872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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172	NC_017280	AGA	2	6	42764	42769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
173	NC_017280	CTA	2	6	42770	42775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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183	NC_017280	AGA	2	6	43034	43039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
184	NC_017280	A	6	6	43052	43057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_017280	T	6	6	43084	43089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_017280	AAG	2	6	43171	43176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
187	NC_017280	TGA	2	6	43193	43198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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